Introducción: Los agentes biológicos que forman parte de los procesos de trabajo en un laboratorio, constituyen un foco de interés especial de la bioseguridad dado el riesgo potencial para el personal asociado a su manipulación. Tanto la percepción como la capacitación de los trabajadores influye en el respeto y cumplimiento de la legislación y las medidas de protección. Objetivos: Este trabajo tuvo como objetivos analizar la aplicación de la legislación de Seguridad Biológica en dos Laboratorios del Instituto Finlay, evaluar el riesgo biológico asociado al incumplimiento de requisitos de Buenas Prácticas de Laboratorio y proponer un programa preventivo para dos laboratorios. Materiales y métodos: Como herramientas de trabajo se utilizaron el método de la observación directa, listas de chequeo, encuesta de tipo cerrada, tormentas de ideas además de métodos cualitativo y semicuantitativo para la evaluación del riesgo. Resultados: Resultó que ambos laboratorios cumplen la legislación vigente de Seguridad Biológica, se identificaron los factores de riesgos más frecuentes y de ellos los de mayor grado de riesgo. Conclusiones: Se obtuvo un programa de Bioseguridad que involucra acciones preventivas y correctivas encaminadas a la solución de problemas detectados. Los objetivos propuestos se cumplieron demostrándose la aplicabilidad de los métodos empleados y se ha implementado el programa preventivo de Bioseguridad con resultados satisfactorios.